Родился в г.Новочеркасске в семье донского казака, личного дворянина,
урядника станицы Преображенской,директора и основателя Донского музея Харитона
Ивановича Попова и его жены Александры Петровны, дочери священника ст.Мигулинской
Донецкого округа.
У Александра были братья и сестры: Екатерина (род.12.11.1859г., умерла во время
Великой Отечественной войны), Мария (27.03.1877–1958, стала женой священника
о.Павла Петровича Автономова), Неонила (19.10.1869–1909), Ольга (28.06.1879–1965),
Мария (род. 27.06.1882г.— после 1886г.), Серафима (29.07.1872–1949, в замужестве Кожина),
Николай (06.05.1864–1919, протоиерей, зарублен большевиками в 1919г.),
Иван (1874–1920), Петр (1867–1960).
Своих десятерых детей Харитон Иванович воспитывал в духе нравственности,
религиозности, трудолюбии и требовательности к себе.
Кроме Александра, еще двое из сыновей Харитона Ивановича стали священниками.
Старший сын, протоиерей Николай принял мученическую кончину в 1919г.
Младший сын Иван, оставив военную карьеру, пошел по стопам братьев, стал
священником (умер от тифа в 1920г.).
Родной брат Александра — генерал-лейтенант от кавалерии Петр Харитонович Попов,
прославился военными подвигами, потом много лет возглавлял Новочеркасское
Военное училище, затем был одним из руководителей белого движения в годы
Гражданской войны, скончался в 1960г. в США на Свято-Владимирском кладбище г.Джексон.