Осуждения
тройка при УНКВД Узбекской ССР 
28/10/1937 
Обвинение "организация нелегальной молельни на дому, систематическая контрреволюционная монархическая агитация" 
Статья ст.66 УК УзССР 
Приговор высшая мера наказания — расстрел с конфискацией имущества 
Групповое дело "дело архиепископа Прокопия (Титова) и священника Иоанна Скадовского, г.Турткуль, 1937г." 
О.Иоанн подтвердил, что, действительно, совершал в своей квартире богослужения.
Он был обвинен в том, что проводил среди верующих контрреволюционную
агитацию против обновленцев как признающих Советскую власть — власть Антихриста —
и что призывал не признавать Советскую власть.
О.Иоанн сказал, что он без исповеди не допускал до участия в богослужениях тех
верующих, которые раньше посещали молитвенные учреждения не истинно православного
направления, в том числе и обновленческого толка.
Свои разногласия с обновленцами о.Иоанн мотивировал тем, что последние нарушили
церковные каноны и содействовали антицерковной политике советской власти, но
пояснил, что об этом среди верующих не рассуждал.
Виновным в контрреволюционной антисоветской агитации о.Иоанн себя не признал