Аресты
Кировская (Вятская) о., колония НКВД 
Год ареста 1942 
День ареста 17 
Месяц ареста 9 
17 сентября 1942г. было начато следствие по новому делу.
В постановлении на арест утверждалось, что, "будучи членом "ИПЦ"", о.Варсонофий
"вел активную антисоветскую деятельность". О.Варсонофий был заключен в тюрьму
г.Котельнича

Осуждения
Закрытое Заседание Военного Трибунала войск НКВД Кировской обл. 
18/08/1943 
Обвинение "один из руководителей к/р церковно-монархической организации "ИПЦ", антисоветская деятельность" 
Статья ст.58 ч.2,58–11 УК РСФСР 
Приговор 10 лет ИТЛ 
В предъявленном обвинении, составленном 4 ноября 1942г.,
говорилось, что о.Варсонофий "являлся одним из руководителей
контрреволюционной церковно-монархической организации "ИПЦ", находясь на
нелегальном положении, вел антисоветскую деятельность".

Следствию удалось "доказать" только то, что он и не скрывал: его причастность
к группе верующих, разделявших взгляды епископа Виктора (Островидова).
Из его показаний на допросе:
     "Я являюсь противником существующей в стране Советской власти как власти
      безбожной и являюсь сторонником прежнего монархического строя в России.
      Хотя и проводил тайные церковные службы, но контрреволюционных групп
      не создавал, к отказу от защиты Советской власти ... не призывал"

Места заключения
Кировская о., г.Котельнич, внутренняя тюрьма НКВД 
Год начала 1942 
День начала 17 
Месяц начала 9 
Год окончания 1943 
День окончания 15 
Месяц окончания 5 
Находился под арестом во внутренней тюрьме НКВД г.Котельнича.
Допросы, состоявшиеся в сентябре-ноябре 1942г., были длительными (продолжались
они, как правило, от 3 до 5 часов), и престарелому архимандриту было трудно их
выдерживать.
В акте медицинского освидетельствования о.Варсонофия, составленный 5 ноября 1942г.,
говорилось, что "у него имеются возрастные изменения организма, возможен
только легкий труд".

15 мая 1943г. о.Варсонофий был переведен из Котельнича в тюрьму г.Яранска
Кировская о., г.Яранск, тюрьма N4 
Год начала 1943 
День начала 15 
Месяц начала 5 
Год окончания 1944 
День окончания 22 
Месяц окончания 3 
В Яранске 18 августа 1943г., накануне праздника Преображения Господня,
с 19 до 20 часов 40 минут вечера проходило закрытое судебное заседание
Военного трибунала войск НКВД Кировской обл.
О.Варсонофий был приговорен к 10 годам ИТЛ с ограничением в правах
по ст.31 УК РСФСР на 5 лет.
После вступления приговора в силу о.Варсонофий находился в заключении в тюрьме
г.Яранска