30.08.1911 hirotonisan vo episkopa Novgorod-Severskogo, vikariya Chernigovskoj eparhii; s 1916 g. episkop Starodubskij, vikarij Chernigovskoj eparhii; s 1917 g. episkop Chernigovskij i Nezhinskij. Chlen Vserossijskogo Pomestnogo Sobora 1917- 1918 gg. V avguste 1922 g. voshel v sostav Sv. Sinoda episkopov Ukraini. V oktyabre 1922 g. arestovan i osuzhden k visilke za predeli Chernigovskoj eparhii na tri goda; v noyabre 1923 g. vozveden v san arhiepiskopa; v 1925 g. prozhival v Moskve bez prava viezda. S kontsa 1925 g. v zaklyuchenii i ssilke. Umer v zaklyuchenii v g. Kotel'nichi Kirovskoj obl. S propoved'yu o Hriste svyatitel' oboshel vsyu Ukrainu, za chto poluchil v narode laskovoe prozvanie "nash apostol". Po ego molitvam Gospod' istselyal lyudej ot dushevnih i telesnih nedugov. I segodnya, po svidetel'stvam ochevidtsev lyudi, poseschayuschie mogilu svyatitelya, poluchayut po ego molitvam ot Gospoda utesheniya i istseleniya. Kanonizirovan 20.08.2000g. RPTsZ. Den' pamyati 28 maya.
           V Vestnike PSTGU za 2009g. vip. II:1 (30). (s.82) bili opublikovani novie dannie k biografii arhiepiskopa Pahomiya so ssilkoj na arhivnij dokument (TsGAOOU. F.263. Op.1. D. 45504. L. 30.). "Ranee bilo izvestno, chto v oktyabre 1922 g. on bil arestovan i osuzhden k visilke za predeli Chernigovskoj eparhii. Cherez neskol'ko mesyatsev on poyavilsya v Moskve. Teper' zhe stanovitsya izvestnim, chto v nachale 1923 g. arhiepiskop Pahomij nekotoroe vremya prozhival v Predmostnoj Slobodke, nahodyaschejsya na Levom beregu Dnepra, naprotiv Kieva (sejchas eto mesto voshlo v sostav Kieva). Predmostnaya Slobodka nahodilas' na samoj granitse mezhdu Kievskoj i Chernigovskoj eparhiyami."